ความพยายามที่จะนำเรือดำน้ำลำใหม่เข้ามาเสริมทัพของกองทัพเรือสเปนต้องประสบกับความล้มเหลว หลังพบว่าเรือดำน้ำลำนี้ไม่สามารถเข้าจอดเทียบท่าได้เพราะมีขนาดใหญ่เกินไป
หนังสือพิมพ์สเปนรายงานว่าเรือดำน้ำ เอส-80 ลำนี้ ถูกออกแบบใหม่หลังก่อนหน้านี้พบปัญหาไม่สามารถการลอยน้ำอยู่เหนือน้ำได้ จนต้องมีการปรับเปลี่ยนแบบให้เรือยาวขึ้นกว่าเดิม แต่หลังจากปรับเปลี่ยนแบบหลายประการแล้วก็พบปัญหาใหม่ เนื่องจากท่าเทียบเรือที่เตรียมไว้มีขนาดเล็กเกินไปที่จะรองรับเรือดำน้ำเจ้าปัญหาลำนี้
ไม่เพียงแต่มีปัญหาเรื่องที่จอด สื่อสเปนยังรายงานด้วยว่างบประมาณที่ใช้ไปกับการต่อเรือดำน้ำก็เพิ่มมากขึ้นเกือบเท่าตัว มีการประเมินว่าราคาสำหรับการสร้างเรือดำน้ำ เอส-80 น่าจะพุ่งสูงจนเกือบถึง 1,000 ล้านยูโรแล้ว
ก่อนหน้านี้เมื่อปี 2557 เจ้าหน้าที่ได้พบปัญหาว่าเรือดำน้ำลำนี้หนักกว่าที่ควรจะเป็นราว 100 ตัน ซึ่งจะทำให้เมื่อถูกปล่อยลงใต้น้ำแล้วเรืออาจจะไม่สามารถลอยลำขึ้นมาได้อีก จนต้องมีการแก้ไขแบบในการจัดสร้างเรือโดยทุ่มงบประมาณ 14 ล้านยูโรเพื่อพัฒนาแบบขึ้นใหม่ ซึ่งวิศวกรและที่ปรึกษาชี้ว่าจะต้องทำให้เรือยาวขึ้น จนเป็นเหตุให้เรือดำน้ำใหญ่เกินกว่าที่จะเข้ามาจอดเทียบท่าได้ในปัจจุบัน
