เมื่อวันที่ 5 ตุลาคม แหล่งข่าวจากคณะรักษาความสงบแห่งชาติ(คสช.)กล่าวถึงโครงการไทยนิยมยั่งยืนของรัฐบาลว่า พล.อ.ประยุทธ์ จันทร์โอชา นายกรัฐมนตรี และ หัวหน้าคสช. ไม่พอใจ ที่กระทรวงต่างๆที่รับผิดชอบโครงการไทยนิยมยั่งยืน อาทิ กระทรวงมหาดไทย กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ กระทรวงพลังงาน กระทรวงสาธารณสุข และ กระทรวงพัฒนาสังคมและความมั่นคงของมนุษย์ เป็นต้น ไม่ผลักดันโครงการอย่างเต็มที่ หลังอนุมัติงบประมาณตามพระราชบัญญัติงบประมาณรายจ่ายเพิ่มเติมประจำปีงบประมาณ พ.ศ. 2561 จำนวน 95,758.1 ล้านบาท ลงไปในพื้นที่ 81,151 ชุมชน แต่ที่ผ่านมาประชาชนไม่รู้จัก ผลงานไม่เกิดขึ้นเป็นรูปธรรม และไม่คืบหน้าเท่าที่ควร ทั้งที่เป็นช่วงใกล้เลือกตั้งในวันที่ 24 กุมภาพันธ์ 2562 ที่นายกฯจำเป็นจะต้องสร้างผลงาน
“นายกฯไม่พอใจมาก ที่รัฐมนตรีต่างๆ มุ่งทำงานในกระทรวงของตัวเองเท่านั้น ขณะที่ข้าราชการก็เกียร์ว่าง ไม่สนใจโครงการไทยนิยมยั่งยืน เป็นผลงานภาพรวมและหน้าตาของรัฐบาล จนเริ่มมีนักการเมืองเข้ามาตรวจสอบ และเชื่อว่าจะนำมาขยายประเด็นให้เห็นประชาชนเห็นถึงความล้มเหลวในช่วงหาเสียงเลือกตั้ง สุดท้ายจะกระทบต่อคะแนนนิยมของรัฐบาลอย่างแน่นอน” แหล่งข่าวในคสช.ระบุ
