ตามที่มีผู้แสดงความห่วงใยการบูรณะพระปรางค์วัดอรุณราชวราราม ราชวรมหาวิหารนั้น พระศากยปุตติยวงศ์ ผู้ช่วยเจ้าอาวาสวัดอรุณราชวราราม ราชวรมหาวิหาร ประธานโครงการบูรณะวัดอรุณราชวราราม ฯ ได้ชี้แจงผ่าน “มติชนออนไลน์ว่า การบูรณะปฏิสังขรณ์พระปรางค์ครั้งนี้ เป็นการบูรณะครั้งใหญ่ในรอบหลายสิบปี นับตั้งแต่การบูรณะครั้งใหญ่ที่สุดสมยรัชกาลที่ 5
ในการบูรณะครั้งนี้ ทางรัฐบาลโดยกรมศิลปากรและวัดอรุณราชวราราม ได้ดำเนินงานบูรณะร่วมกันอย่างใกล้ชิด โดยมีการศึกษาค้นคว้าทางวิชาการอนุรักษ์เพื่อออกแบบบูรณะให้ถูกต้องตามหลักวิชาการและรักษาความเป็นของแท้ดั้งเดิมให้มากที่สุด ทั้งรูปแบบสถาปัตยกรรมและวัสดุ นับเป็นตัวอย่างที่ดีที่สุดในการบูรฯะโบราณสถานในยุคนี้
กระเบื้องสีที่นำขึ้นไปประดับบนองค์พระปรางค์ เป็นการซ่อมเปลี่ยนแทนวัสดุเดิมที่ร่วงหล่น ส่วนที่เป็นของดั้งเดิมที่ยังคงสภาพดีอยู่ ก็คงไว้ดังเดิม ซึ่งรูปถ่ายที่มีผู้นำมาเปรียบเทียบลักษณะก่อนและหลังบูรณะนั้น เป็นการนำภาพปรางค์ทิศมาเปรียบกับปรางค์ประธาน ลวดลายและทรวดทรงจึงแตกต่างกัน
ส่วนขององค์ปรางค์ที่เห็นเป็นสีขาวนั้น เกิดจากการทำความสะอาดคราบตะไคร่น้ำและทาสีน้ำปูน ซึ่งเป็นสีดั้งเดิมขององค์พระปรางค์ ไม่ได้มีการเปลี่ยนแปลงใดๆ
ขอย้ำว่าการบูรณะครั้งนี้ ได้มีการศึกษาค้นคว้าก่อนการดำเนินการ และบันทึกรายละเอียดระหว่างการทำงาน และควบคุมดูแลโดยเจ้าหน้าที่ของกรมศิลปากรที่มีความรู้ความชำนาญ และอยู่ในสายตาของวัด ทุกขั้นตอนตั้งแต่เริ่มดำเนินจนเสร็จสมบูรณ์
