ในระหว่างการหารืออธิบดีกรมเอเชียใต้ฯ ได้แจ้งมติที่ประชุมศูนย์บริหารสถานการณ์การแพร่ระบาด ของโรคติดเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 ให้ยกเลิกการอนุมัติและการพิจารณาคำขอเที่ยวบินทหารอียิปต์รวม 4 เที่ยวบินในวันที่ 17 และ 25 กรกฎาคม 2563 เนื่องจากกรณีลูกเรือทหารอียิปต์ ที่ติดเชื้อโควิด-19 ไม่ปฏิบัติตามมาตรการของไทย เป็นประเด็นที่สาธารณชนแสดงความห่วงกังวลอย่างมาก และยังไม่สามารถให้ข้อมูลได้ว่าฝ่ายไทยจะรับพิจารณาคำขอเรื่องนี้ได้อีกเมื่อใด รวมทั้งขอให้สถานเอกอัครราชทูตอียิปต์แจ้งให้เจ้าหน้าที่ที่จะเข้ามาปฏิบัติภารกิจในประเทศไทยปฏิบัติตามกฎระเบียบ และมาตรการการป้องกันการแพร่ระบาดของเชื้อไวรัสโควิด-19 ของฝ่ายไทยอย่างเคร่งครัด เพื่อป้องกันปัญหาที่อาจเกิดขึ้นอีกในอนาคต
เอกอัครราชทูตอียิปต์ประจำประเทศไทยได้แสดงความเสียใจต่อเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นและให้คำมั่นว่าเหตุการณ์ในลักษณะดังกล่าวจะไม่เกิดอีก ที่ผ่านมามีเที่ยวบินทหารบินเข้ามาอย่างต่อเนื่อง โดยไม่เคยเกิดเหตุการณ์เช่นนี้ ในครั้งนี้ ลูกเรือทุกคนได้รับการตรวจเชื้อโควิด-19 ก่อนเดินทางแล้ว แต่ปรากฏภายหลังว่ามีลูกเรือที่ติดเชื้อโควิด-19 และมีผู้ที่ไม่ปฏิบัติตามระเบียบของทางการไทย ซึ่งก่อนหน้านี้สถานเอกอัครราชทูตอียิปต์ได้เคยรับประกันกับกระทรวงการต่างประเทศและหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง รวมทั้งแจ้งลูกเรือให้ปฏิบัติตามมาตรการของไทยแล้ว
