วันที่ 9 ธันวาคม 2559 ผู้สื่อข่าวรายงานว่า ระดับแม่น้ำโขงทางด้าน อ.เชียงแสน จ.เชียงราย ได้ลดระดับอย่างรวดเร็ว เกิดเกาะทรายขึ้นกลางลำน้ำโขงบริเวณด้านหน้าที่ว่าการ อ.เชียงแสน จนมองเห็นได้ชัดเจน นอกจากนี้ ระดับน้ำที่ลดลงยังทำให้กระทบต่อการขนส่งทางน้ำ โดยเรือขนาดใหญ่ 300-450 ตันไม่สามารถสัญจรไปมาได้ ส่วนเรือขนาดเล็กลงมาสามารถบรรทุกสินค้าและเดินทางไปยังประเทศจีนได้แต่ต้องอาศัยความชำนาญของกัปตันเรือจึงจะสามารถนำเรือใส่สินค้าทวนน้ำขึ้นไปได้ ส่วนเรือท่องเที่ยวขนาดเล็กและกลางในแม่น้ำโขงยังสามารถสัญจรไปมาได้ แต่คนขับเรือก็ต้องใช้ความระมัดระวังในการขับเรือเป็นพิเศษ
นายทอง ผาจอง ผู้ประกอบการขนส่งทางน้ำที่ขนส่งสินค้าไปประเทศจีน มีเรือที่ต้องดูแลในแม่น้ำโขงเป็นจำนวนมากเปิดเผยว่า ระดับน้ำที่ลดลงอย่างรวดเร็วมีผลกระทบต่อการเดินเรือสินค้าเป็นอย่างมาก โดยเฉพาะที่ป่าแหลว ระดับน้ำมีเพียงแค่ 60 เซนติเมตร ซึ่งปกติก่อนที่น้ำจะแห้งลงขนาดนี้ทางการจีนจะทำการปล่อยน้ำมาจากเขื่อนจิ่งหงโดยเฉลี่ยวันละ 1,200-1,800 ลูกบาศก์เมตรต่อวินาที ทำให้ระดับน้ำเพียงพอต่อการเดินเรือ แต่ที่ผ่านมาเมื่อ 5 วันก่อนทางเขื่อนจีนได้ปล่อยน้ำออกมาเพียง 500-800 ลูกบาศก์เมตรต่อวินาที ทำให้ระดับน้ำลดลงอย่างรวดเร็วจนสร้างผลกระทบกับการเดินเรือ แต่เชื่อว่าไม่กี่วันระดับน้ำจะกลับมาเป็นปกติเมื่อเขื่อนได้ปล่อยน้ำลงมาตามเดิม
ด้านนายสุรนาถ ศิริโชติ รักษาการผู้อำนวยการสำนักงานเจ้าท่าภูมิภาคสาขาเชียงราย เปิดเผยว่า ในช่วงอาทิตย์ที่ผ่านมาระดับน้ำในแม่น้ำโขงลดลงอย่างรวดเร็ว โดยเมื่อวันที่ 3 ธันวาคม ระดับน้ำโขงอยู่ที่ 3.97 เมตร ในวันนี้ระดับน้ำลดลงเหลือ 2.27 เมตร ซึ่งจากเหตุดังกล่าวสำนักงานเจ้าท่าภูมิภาคสาขาเชียงรายได้แจ้งคณะทำงานตามความตกลงว่าด้วยการเดินเรือพาณิชย์ฝ่ายไทย (JCCCN ฝ่ายไทย) ให้ประสานทำงานตามความตกลงว่าด้วยการเดินเรือพาณิชย์ฝ่ายจีน (JCCCN ฝ่ายจีน) เพื่อขอทราบสาเหตุของระดับน้ำโขงที่ลดลง โดยหากเหตุดังกล่าวเกิดจากการลดอัตราระบายน้ำที่เขื่อนจิ่งหง ก็ขอให้ทางฝ่ายจีนแจ้งข้อมูลให้ประเทศสมาชิกได้ทราบด้วย เนื่องจากส่งผลกระทบต่อความปลอดภัยในการเดินเรือขนส่งสินค้าและชีวิตความเป็นอยู่ของประชาชนที่อยู่ท้ายน้ำ ซึ่งตอนนี้เรื่องดังกล่าวอยู่ระหว่างการประสานงาน
