วันที่ 13 มกราคม 2560 รายงานข่าวสถานีรถไฟชุมทางหาดใหญ่ บรรยากาศเงียบเหงาและแทบกลายเป็นสถานีร้าง โดยเฉพาะตั้งแต่เวลา 14.00 น.ของทุกวัน ซึ่งเป็นช่วงที่ขบวนรถด่วนและรถเร็วเริ่มออกจากสถานีรถไฟหาดใหญ่ขึ้นกรุงเทพฯ สาเหตุมาจากเส้นทางรถไฟสายใต้กลายเป็นอัมพาตตั้งแต่วันที่ 4 มกราคม จากเหตุน้ำท่วมรางรถไฟเสียหายหลายจุด ขบวนรถไฟสายใต้เส้นทางขึ้นล่องกรุงเทพฯต้องหยุดให้บริการทั้งหมด ไม่สามารถเดินทางขึ้นล่องถึงปลายทางทั้งกรุงเทพฯ-หาดใหญ่ ในพื้นที่ 3 จังหวัดชายแดนภาคใต้ได้ และต้องหยุดยาวมา 9 วัน
การจราจรทางรถไฟที่เป็นอัมพาตทำให้กระทบกับบรรดาร้านค้าและพ่อค้าแม่ค้ารายย่อยบริเวณชานชาลาที่ส่วนใหญ่ปิดร้านชั่วคราว เนื่องจากผู้โดยสารน้อยลงมาก จะมีเพียงรถไฟขบวนท้องถิ่นระหว่าง จ.พัทลุงถึงสุไหงโก-ลกเท่านั้น
นายบรรหาร โกบยาหยัง ผู้อำนวยการฝ่ายปฏิบัติการเดินรถภาค 4 การรถไฟแห่งประเทศไทย เปิดเผยว่า เจ้าหน้าที่รถไฟกำลังเร่งซ่อมแซมรางรถไฟสายใต้ที่ถูกน้ำกัดเซาะรางเสียหายกว่า 70 จุด และคาดว่าจะใช้เวลาซ่อมแซมแล้วเสร็จภายในวันที่ 20 มกราคม และเปิดทางเดินรถได้ตั้งแต่วันที่ 21 มกราคม 2560
“จุดที่เสียหายหนักมากที่สุดอยู่ระหว่างสถานีชะอวดกับสถานีบ้านตูน อ.ชะอวด จ.นครศรีธรรมราช ซึ่งคอสะพานขาดยาว 9 เมตร ลึก 5 เมตร และเป็นจุดที่ต้องใช้เวลาซ่อมนานที่สุด” นายบรรหารกล่าว
นายบรรหารเปิดเผยว่า ความเสียหายของเส้นทางรถไฟสายใต้จากเหตุน้ำท่วมใหญ่ในครั้งนี้รุนแรงที่สุดในรอบ 29 ปี นับตั้งแต่เหตุภัยพิบัติครั้งรุนแรงที่สุดของภาคใต้เมื่อปี 2531
