เมื่อวันที่ 21 กันยายน 2560 ที่องค์การสงเคราะห์ทหารผ่านศึก (อผศ.) พล.อ.ประวิตร วงษ์สุวรรณ รองนายกรัฐมนตรี และรัฐมนตรีว่าการกระทรวงกลาโหม กล่าวถึงกรณีเจ้าหน้าที่ตำรวจได้ควบคุมตัวพระมหาอภิชาติ ปุณฺณจนฺโท มายังวัดเบญจมบพิตร เพื่อบังคับให้ลาสิกขา ณ พระอุโบสถ วัดเบญจมบพิตร ว่า ตนได้รับรายงานมาว่าท่านลาสิกขาแล้ว โดยเป็นความต้องการและความสมัครใจของท่านเอง ทั้งนี้ จากการแสดงความคิดเห็นที่ผ่านมาของอดีตพระอภิชาติ ตนคิดว่ากระทบกระเทือนต่อความมั่นคงทางด้านศาสนา ซึ่งถ้าฟังคลิปจะรู้เอง พร้อมทั้งย้ำว่าเจ้าหน้าที่ไม่ได้นำตัวอดีตพระอภิชาติเข้าควบคุมตัวที่ค่ายทหารแต่อย่างใด เพราะเป็นเรื่องของเจ้าหน้าที่ตำรวจดำเนินการ
