“เจ้านายราชตระกูล ตั้งแต่ลูกฉันเป็นต้นไป ตลอดจนถึงราษฎรที่ต่ำที่สุด จะได้มีโอกาสเล่าเรียนเสมอกัน ไม่ว่าเจ้าว่าไพร่ เพราะฉะนั้นจึงขอบอกได้ว่า การเล่าเรียนในเมืองเรานี้จะเป็นข้อสำคัญหนึ่งซึ่งฉันจะอุตส่าห์จัดขึ้นให้เจริญจงได้”
พระบรมราโชวาท พระบาทสมเด็จพระจุลจอมเกล้าเจ้าอยู่หัว สมเด็จพระปิยมหาราช รัชกาลที่ 5 เมื่อวันศุกร์ เดือน 5 ขึ้น 12 ค่ำ ปีระกา พ.ศ.2427
ปีเดียวกันนั้น ทรงโปรดเกล้าฯให้พระองค์เจ้าดิศวกุมาร ตั้งโรงเรียนหลวงเพิ่มขึ้นในวัดหลายแห่งทั้งในกรุงเทพฯ และหัวเมือง แห่งแรกสร้างที่วัดมหรรณพาราม
เดิมชื่อโรงเรียนวัดมหรรณพาราม ต่อมาเรียกว่าโรงเรียนวัดมหรรณพ์ สังกัดกระทรวงศึกษาธิการ
พ.ศ.2479 กระทรวงศึกษาธิการยุบเลิกโรงเรียนมัธยมวัดมหรรณพ์ มอบให้จังหวัดพระนครจัดตั้งเป็นโรงเรียนประชาบาล เมื่อวันที่ 25 กรกฎาคม พ.ศ.2480 มีหลวงอักษรศาสตร์สมบูรณ์ นายอำเภอพระนครเป็นผู้จัดตั้งโรงเรียนประชาบาลขึ้น ตั้งชื่อโรงเรียนประชาบาลเสาชิงช้า (วัดมหรรณพ์)
ต่อมา วันที่ 27 พฤศจิกายน 2480 จังหวัดพระนครโอนโรงเรียนประชาบาลเสาชิงช้า (วัดมหรรณพ์) ให้เทศบาลนครกรุงเทพ และเปลี่ยนชื่อเป็นโรงเรียนเทศบาล 22 (วัดมหรรณพ์)
วันที่ 29 พฤษภาคม พ.ศ.2556 สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ทรงรับโรงเรียนวัดมหรรณพารามเข้าไว้ในพระราชูปถัมภ์ ตามหนังสือสำนักราชเลขานุการ ที่ รล.0010/4991 ลงวันที่ 3 มิถุนายน พ.ศ.2556 ความว่า
สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ทรงมีพระราชกระแสว่า จากประวัติของโรงเรียนแห่งนี้เป็นโรงเรียนที่พระบาทสมเด็จพระจุลจอมเกล้าเจ้าอยู่หัวทรงพระกรุณาโปรดเกล้าฯ ให้ตั้งขึ้นเมื่อปี พ.ศ.2427 ใช้ชื่อว่า “โรงเรียนวัดมหรรณพาราม” เป็นโรงเรียนหลวงสำหรับราษฎร์ และเป็นโรงเรียนวัดแห่งแรกของประเทศไทย ดังนั้น เห็นสมควรให้กลับมาใช้ชื่อ “โรงเรียนวัดมหรรณพาราม” ดังเดิม เพื่อเป็นการรักษาไว้ซึ่งเกียรติประวัติและความเป็นมาของโรงเรียนดังกล่าวสืบไป
พร้อมกันนี้ ทรงรับโรงเรียนวัดมหรรณพารามอยู่ในพระราชูปถัมภ์ ตั้งแต่วันพุธที่ 29 พฤษภาคม พ.ศ.2556
วันที่ 5 กรกฎาคม พ.ศ.2556 (ผู้ว่าราชการกรุงเทพมหานคร หม่อมราชวงศ์สุขุมพันธุ์ บริพัตร) ได้มีประกาศกรุงเทพมหานคร เรื่องการแบ่งส่วนราชการภายในหน่วยและการกำหนดอำนาจหน้าที่ของส่วนราชการกรุงเทพมหานคร (ฉบับที่ 84) เพื่อประกาศเปลี่ยนชื่อโรงเรียนจากเดิม โรงเรียนวัดมหรรณพ์ เป็น “โรงเรียนวัดมหรรณพาราม” ประกาศกรุงเทพ ณ วันที่ 5 กรกาคม พ.ศ.2556
โรงเรียนวัดมหรรณพาราม ที่วัดมหรรณพาราม ตำบลเสาชิงช้า อำเภอพระนคร ใกล้ศาลเจ้าพ่อเสือ สังกัดกรุงเทพมหานคร มีนางวาสนา เจียนสุวรรณ เป็นผู้อำนวยการ กรรมการและเลขานุการ กรรมการสถานศึกษา
คณะกรรมการสถานศึกษาประกอบด้วย นายเสฏนันท์ อังกูรภาสวิชญ์ เป็นประธานกรรมการ นายคณิต เสริมสิริมงคล เป็นรองประธาน คณะกรรมการประกอบด้วย นางสาวชัญญนิฏฐ์ มณีเอี่ยม นายพลายแก้ว สุวรรณะ ผู้อำนวยการเขตพระนคร นายประสิทธิ์ มธุวาส พระครูบวรวิหารการ นายสินชัย เตชัสหงส์ นางสาวพนิดา ภิสัชเพ็ญ จ่าสิบเอกสุพจน์ นามเดช นางจีรมาศ จริยเศรษฐวงศ์ นางรุ่งนภา เตชะอาภรณ์ชัย นายสมัคร ปิ่นชุมพลแสง
ดาบตำรวจสุพงษ์พิทักษ์ ร่วมเริง ประธานเครือข่ายผู้ปกครอง นายประจวบ ยอดขาว รองประธานเครือข่ายผู้ปกครอง นางวรรณา ยอดขาว กรรมการเครือข่ายผู้ปกครอง
พระเทพสุตเมธี ประธานที่ปรึกษา นายณรงค์ฤทธิ์ จริยเศรษฐวงศ์ กรรมการที่ปรึกษา ดร.เรืองชัย ทรัพย์นิรันดร์ กรรมการที่ปรึกษา
นอกจากนั้น มีโรงเรียนมหรรณพารามอีกแห่งหนึ่ง ก่อตั้งเมื่อวันที่ 21 มีนาคม พ.ศ.2516 เป็นโรงเรียนมัธยม เดิมสังกัดกรมสามัญศึกษา ปัจจุบันสังกัดสำนักงานการศึกษาขั้นพื้นฐาน ตั้งอยู่ที่แขวงฉิมพลี เขตตลิ่งชัน กรุงเทพฯ เปิดสอนเมื่อ พ.ศ.2516 ตั้งชื่อโดยพระราชวรเมธี เจ้าอาวาสวัดมหรรณพาราม ตามชื่อโรงเรียนวัดมหรรณพ์
