วันที่ 4 พฤษภาคม 2559 เมื่อเวลา 14.00 น. องค์การบริหารส่วนตําบลไม้รูดได้รับแจ้งจาก นายอัศวิน ถาวรสาลี อายุ 59 ปี ว่ามีบ่อเลี้ยงกุ้งได้ปล่อยนํ้าเสียลงสู่ตามลำคลองหมู่บ้านคลองมะนาวที่ขณะนั้นมีระดับน้ำลดลงเนื่องน้ำลง ซึ่งน้ำที่เน่าเสียนํ้าเป็นสีเขียวเหมือนมรกตและมีกลิ่นเหม็นตั้งแต่เวลาเช้า ทำให้ปลาอาศัยอยู่จำนวนมากตายลอยขึ้นมาจำนวนนับพันตัว บางตัวยังไม่เสียชีวิต ส่วนกระชังปลาของชาวบ้านที่เลี้ยงไว้ เช่น ปลาผีเสื้อก็ได้รับความเดือดร้อน เนื่องจากเกิดปัญหาเช่นนี้มาหลายครั้งแล้ว
ต่อมา นายสุรศักดิ์ อินทรประเสริฐ นายก อบต.ไม้รูด ทราบเรื่องจึงได้ประสานงานกับส่วนราชการที่เกี่ยวข้อง ประกอบด้วย นายบงการ บุญสนธิ์ ปลัดอําเภอคลองใหญ่ นายชัชวาล วุฒิธิเมธี นักวิชาการประมง จ.ตราด นายชายดาว ขําวงค์ ผู้ใหญ่บ้านคลองมะนาว พร้อมด้วยชุดปฎิบัติการที่ 23 บ้านไม้รูด ได้ลงพื้นที่ตรวจสอบหลังนายอัศวิน ถาวรสาลีได้ร้องเรียนไปยังองค์การบริหารส่วนตําบลไม้รูด
จากการตรวจสอบพบว่า มีการปล่อยนํ้าเสียจากบ่อกุ้งลงสู่ตามลําคลอง ทราบชื่อต่อมาเป็นบ่อเลี้ยงกุ้งของ นางกาญวดี มัณฑิกาวิท อายุ 46 ปี ในหมู่ที่ 2 ต.บางปิด อ.แหลมงอบ จ.ตราด ได้มาเลี้ยงกุ้งอยู่ที่บ้านคลองมะนาว หมู่ที่ 4 บ้านคลองมะนาวมาตั้ง 5-6 ปีแล้ว และได้จับกุ้งในบ่อเมื่อช่วงเช้าที่ผ่านมา อย่างไรก็ตาม 2-3 วันที่ผ่านมา มีบ่อเลี้ยงกุ้งหลายบ่อได้ทำการจับกุ้งและไม่ทราบว่าบ่อเลี้ยงกุ้งของใครปล่อยนํ้าเสียลงสู่ตามลําคลองบ้านคลองมะนาวซึ่งชาวบ้านยืนยัน ว่านํ้าในคลองเป็นนํ้าสีเขียวมานานแล้ว

จากนั้น นายชัชวาล นักวิชาการประมงจังหวัดตราดได้ตักนํ้าไปตรวจหาสาเหตุการเกิดทําให้ปลาในคลองตายและชาวบ้านที่เลี้ยงปลาในกระชังได้รับความเดือดร้อน นายชัชวาล บอกว่าประมาณวันที่ 5 จะรู้ผลว่าสาเหตุเกิดจากอะไร
นายอัศวิน กล่าวว่า มีน้ำเสียเข้ามาที่บ่อกุ้งมาที่คลองมะนาว แต่ไม่ทราบจากบ่อกุ้งของใครเพราะมีการจับหลายบ่อ ซึ่งทำให้ปลาตาย จึงร้องไปที่อบต.ไม่รูดให้เข้ามาดูแลและแก้ไข ซึ่งนายกอบต.ไม้รูดและเจ้าหน้าที่ได้มาดูแลแก้ไขแล้ว
ส่วนนายจำเริญ บุญรักษา อายุ 48 ปี อยู่บ้าน หมู่ 4 บ้านคลองมะนาว กล่าวว่า ก่อนหน้านี้ได้ทำธุรกิจเลี้ยงปลาในกระชังมานาน แต่ระยะหลังเริ่มมีปัญหาและปลาที่เลี้ยงเริ่มตายเพราะน้ำเสียที่ปล่อยจากนากุ้ง ทำให้ต้องเลิกเลี้ยงเพราะเลี้ยงไปก็ขาดทุน เพราะแก้ปัญหาเรื่องน้ำเสียไม่ได้