เมื่อวันที่ 5 มกราคม นายธรณ์ ธำรงนาวาสวัสดิ์ รองอธิการบดี คณะประมง มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ นักวิชาการด้านสิ่งแวดล้อมทางทะเล โพสต์ข้อความผ่านเฟซบุ๊ก Thon Thamrongnawasawat โดยระบุถึงผลกระทบหลายด้านจากพายุปาบึกว่า เริ่มเข้าสู่ช่วงสำรวจความเสียหายและฟื้นฟู ขอเริ่มต้นจากสัตว์ทะเลหายาก คลื่นส่งผลต่อสัตว์น้ำ โดยเฉพาะลูกสัตว์น้ำ เช่น ลูกโลมาอิรวดีที่ตาย และถูกพัดขึ้นมาเกยฝั่งแถวขนอม รังเต่ามะเฟืองที่เขาหลักไม่น่ามีปัญหา แต่รังที่สองที่ท่าไทร คลื่นกัดเซาะชายฝั่งเข้าไปมาก จนอยู่ห่างรังไข่เต่าไม่กี่เมตร ตอนนี้เจ้าหน้าที่กรมทะเลและอุทยานท้ายเหมือง กำลังติดตามอย่างใกล้ชิด หากเกิดเหตุฉุกเฉินคงสามารถช่วยเหลือได้ทัน สำหรับสัตว์น้ำอื่น โดยเฉพาะสัตว์น้ำหน้าดิน อาจได้รับผลกระทบจากคลื่นบ้าง แต่ที่น่าห่วงกว่านั้น น้ำจืดจำนวนมากไหลลงทะเล ทำให้เกิดปรากฏการณ์น้ำเบียดความเค็มแถวปากแม่น้ำและชายฝั่งจะลดลงอย่างเร็ว น้ำอาจแบ่งเป็น 2 ชั้น อาจทำให้สัตว์น้ำตายเหมือนที่เคยเกิดตามชายฝั่งเพชรบุรี-ชะอำ
คราวนี้มาถึงระบบนิเวศทางทะเลบ้างระบบนิเวศที่ได้รับผลมากสุดคือแนวปะการังน้ำตื้นที่ฟื้นตัวช้า พายุปาบึกเคลื่อนที่เป็นวงกว้างทั้งอ่าวไทยและอันดามันผลกระทบต่อแนวปะการัง คือ คลื่น ตะกอน และน้ำจืดไหลลงทะเล คลื่นส่งผลทำให้ปะการังน้ำตื้นแตกหัก
คลื่นจะส่งผลต่อแนวปะการังน้ำตื้นแถวสมุยและพะงันมากหน่อย เพราะทั้ง 2 เกาะรายล้อมด้วยแนวปะการังรวมถึงหมู่เกาะว่าวที่อยู่ทางตอนเหนือเกาะกระ (นคร) พื้นที่คุ้มครองทางทะเลแห่งใหม่ก็น่าจะได้รับผล เนื่องจากเป็นแนวพายุเข้า
ผลอันดับสองคือตะกอน ซึ่งน่าจะเป็นผลกระทบแรงสุด และต่อเนื่องหลายวันตะกอนบางส่วนเกิดจากคลื่นพัดขึ้นมาจากพื้นท้องทะเล ทำให้น้ำขุ่น แสงส่องผ่านไม่ได้หลายวันตะกอนยังตกทับบนปะการัง ทำให้ปะการังอ่อนแอหรืออาจตายได้
ผลอันดับสาม น้ำจืดจำนวนมากส่งผลกับความเค็มน้ำทะเลลดลงอย่างรวดเร็ว ทำให้ปะการังอาจฟอกขาวฉับพลันในบางพื้นที่ เพราะฉะนั้น ควรต้องสำรวจแนวปะการังในหลายพื้นที่ในภาคใต้ฝั่งอ่าวไทยเกือบทั้งหมด ปัญหาอีกประการคือขยะทะเลจำนวนมาก มักเกิดหลังน้ำท่วมใหญ่ หน่วยงานต่างๆ ที่เกี่ยวข้อง คงต้องเตรียมการเก็บขยะตามชายหาดขยะในทะเลอ่าวไทย รวมถึงการดำน้ำเก็บขยะที่ตกค้างและสร้างความเสียหายให้แนวปะการังน้ำตื้น สมุย พะงัน ชุมพร ประจวบ ฯลฯ
